Судебная система Чехии состоит из:
- Конституционного суда
- Судов общей юрисдикции:
- Верховного суда (в частности, Верховного суда и Высшего административного суда),
- высших судов,
- краевых судов,
- районных (окружных) судов.
Суды не только независимы от других государственных органов, но и независимы друг от друга. В системе судов нет отношений превосходства и подчинения. Если вышестоящий суд отменит решение суда первой инстанции и вернет ему дело с обязательным юридическим заключением, он сделает это только на основании предоставленных законом полномочий принимать решения о средствах правовой защиты, а не на основании своего «превосходного» положения. Благодаря этому у судов есть полномочия решать спорные судебные дела, в которых одним из участников спора является государство, например в административном делопроизводстве.
Суды в Чехии подчиняются Министерству юстиции, но при этом Министерство юстиции не вмешивается в деятельность судов.

В порядке, установленном законом, суды:
- обеспечивают защиту прав в гражданском и уголовном судопроизводстве,
- решают вопрос о виновности и наказании за уголовные правонарушения,
- в административном правосудии рассматривают акты органов государственного управления,
- в конституционном правосудии решают вопросы соблюдения правовых норм и решений конституции,
- принимают решения по другим вопросам, которые возложены на них законом.
Конституционный суд не входит в систему судов общей юрисдикции.

Если нарушены права человека, пострадавший (им может быть человек, организация, политическая партия или общественное движение) обращается именно в Конституционный суд. Там принимают решение об отмене юридических предписаний по жалобам, связанным с нарушением конституционных прав и свобод граждан. Все права и свободы граждан прописаны в Конституции Чешской Республики, Декларации основных прав и свобод и в других конституционных законах страны.
Краевой суд является одним из основных звеньев в системе судов общей юрисдикции.
В Чехии существует восемь региональных судов:
- Городской суд в Праге (юрисдикция Праги)
- Краевой суд в Праге (юрисдикция Центральночешского края)
- Краевой суд в Ческе-Будеёвице с филиалом в Таборе
- Краевой суд в Пльзене
- Краевой суд в Усти-над-Лабем с филиалом в Либереце
- Краевой суд в Градец-Кралове с филиалом в Пардубице
- Краевой суд в Брно с филиалом в Йиглаве и филиалом в Злине
- Краевой суд в Остраве с филиалом в Оломоуце